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2019 年 10 月 16 日

ソフトウェア構成

OSについて

2019年3月現在、スーパーコンピュータシステムは、OS として Linux を採用しており、計算ノードはディストリビューションとして Red Hat Enterprise Linux 7 と CentOS 7 を利用しています。

ノードOSバージョン
検疫ゲートウェイノード Red Hat Enterprise Linux 7   7.5
ゲートウェイノード Red Hat Enterprise Linux 7   7.5
Thin計算ノード CentOS7 7.5
Medium計算ノード Red Hat Enterprise Linux 7 7.5
Fat計算ノード Red Hat Enterprise Linux 7 7.5

 

ジョブ管理システムについて

スーパーコンピュータシステムでは、Univa Grid Engine(UGE)を ジョブ管理システムとして利用しています。 Univa Grid Engineとは、旧Sun Micro Systems社が所有していたオープンソースソフトウェアであるSun Grid Engine6.2U5をから派生した商用製品で、基本的なシステム概念、ユーザコマンド体系等は Sun Grid Engineと同一です。 UGEを利用したシステムの基本的な利用方法についてはシステム利用方法をご参照ください。

UGEのジョブ関連上限設定について

1ユーザが同時利用可能ジョブスロット数は、以下の通りです。

設定項目設定値
ジョブスロット上限(一般研究用アカウント) 300
ジョブスロット上限(大規模利用アカウント) 300
1ユーザ当りジョブ投入上限 5000
1ユーザ当り投入タスク上限 75000

計算機リソース拡張申し込みを行うことで、ジョブスロット上限は大規模利用アカウントまでの拡張が許可されますので 必要な方は申請を行ってください。(※現在準備中です。しばらくお待ちください。)

キュー構成について

利用する計算ノードの種別と利用期間により以下のキューを設定しています。(2019年03月現在)

Phase3システム 2019年3月導入 

キュー名ジョブスロット数実行時間の上限用途キュー指定のオプション 
epyc.q 4,224 62日 実行時間2ヶ月間で他にリソース要求が無い時      指定なし または -l month(デフォルト)
intel.q 1,472 62日 Intel Xeonを使用 -l intel または -l month -l intel
gpu.q 384 62日 GPUを使用 -l gpu または -l month -l gpu
medium.q 160 62日 Medium計算ノードを使用 -l medium または -l month -l medium
login.q 258 無期限 ゲートウェイノードからqloginする際に利用  
login_gpu.q 48 無期限 GPUを使用する際にゲートウェイノードからqlogin  
short.q 744 3日 短時間ジョブ向け -l short

 ジョブの投入方法、ジョブ管理システムの具体的な利用法については、システム利用方法をご参照ください。

利用可能なソフトウェア一覧について

下記リンクを参照してください。
 

ファイル転送ソフトウェアについて

システム内と外部のデータ転送には、sftp,scpasperaが利用可能です。具体的な転送方法については、ファイル転送をご参照ください。